商標注冊主管部門是國家商標局，辦理商標注冊申請流程主要有：

1、先對想要申請的注冊商標進行查詢申請，主要查詢商標是否有相同或者近似的，如果沒有可以繼續進行商標注冊申請工作注冊商標是哪個部門，如果有相同或者近似情況產生的，商標申請人需要更改其他名字重新進行查詢，直到沒有相同或者近似的情況;

2、準備商標申請資料，商標查詢無誤后，需要開始準備商標注冊申請資料;公司申請的，需要公司營業執照復印件、商標圖樣、注冊商標所使用的商品或者服務的范圍(商標注冊類別的選擇);自然人申請商標注冊，需要個體工商營業執照及個人身份證明文件注冊商標是哪個部門，以及注冊商標所使用的明確商標注冊類別的選擇;商標圖樣等;

3、提交商標注冊申請并下發商標受理通知書，由商標注冊代理公司辦理商標的，需要商標代理公司顧問把商標申請人資料提交至商標局;由申請人自行辦理商標的，直接有商標申請人將資料提交至商標局;商標局受到商標提交資料后，會在規定時間內下發商標受理通知書注冊商標是哪個部門，表明商標注冊已經開始受理;

4、商標局審查階段，審查階段大致用時為十三至十五個月左右，其中形式審查需要大概1-3個月;實質審查需要10個月左右;

5、公告期，公告期包括初審公告和注冊公告。商標實質審查合格后，進入初審公告階段;初審公告期為3個月，也叫異議期。如異議或者異議裁定失敗的，進入注冊公告期。商標注冊申請整理流程順利的話，需要大概一年半到兩年的時間。